Ко времени крещения Руси в Киеве и других городах уже существовали славяноязычные иудейские общины смешанного этнического состава. В том числе, летопись сообщает об участии «хазарских иудеев» в «испытании вер» князем Владимиром. В конце XV в. в Новгороде возникает движение жидовствующих, сторонников которого обвинили в отходе от православного вероисповедания, а также в приверженности иудейской традиции. В результате жестокого подавления «ереси», иудеям был запрещен въезд в Московское царство. После разделов Польши в конце XVIII в. восточные владения королевства с большим еврейским населением были включены в состав Российской империи. До этого правительство, пытаясь сохранить традиции, пыталось не распространять и не пускать иудаизм в государстве.

После перехода евреев под власть России при Екатерине II иудеи стали гражданами государства, хотя и с большими ограничениями в правах. С 1795 г. законодательно оформилась «черта оседлости евреев», точнее, «лиц иудейского вероисповедания» (Белоруссия, Литва, Украина, Новороссия), за пределы которой иудеи не имели права свободно выезжать и селиться.

В 1802 г. в начале царствования Александра I с негласного разрешения властей создается Санкт-Петербургская иудейская религиозная община. Разрешалось по особым разрешениям, посещать внутренние губернии иудеям-промышленникам, купцам, художникам и ремесленникам. Запрещались преследования хасидов. В 1817 г. было запрещено обвинять иудеев в совершении ритуальных убийств на основании лишь предрассудков. Однако, большая часть либеральных начинаний осталась на бумаге. Мистически настроенный Александр I даже учредил общество «израильских христиан». По уставу члены этого общества получали большие экономические и правовые льготы и привилегии. Однако в 1833 г. общество было закрыто ввиду отсутствия достойных претендентов.

В период царствования Николая I положение иудеев стало хуже, на них была распространена рекрутская повинность, причем в повышенной норме. Призывали в «кантонисты» подростков с 12 лет, которых зачастую насильно заставляли креститься. Однако отслужившие 25-летнуюю службу «николаевские» солдаты иудейского вероисповедания имели право повсеместного проживания, в результате иудейские общины появляются и за пределами «черты оседлости». В 1844 г. кагалы «как оплот религиозного фанатизма» упраздняются. В конце царствования Николая I правительство переживало о распространении среди крестьян «еретических» сект жидовствующих (или субботников), отвергавших христианскую традицию. Хотя было доказано отсутствие миссионерской деятельности со стороны евреев, все равно это привело к усилению ограничений для иудеев. Нередко также возникали обвинения в ритуальных убийствах, хотя все расследования показывали их беспочвенность.

В царствование Александра II был отменен институт «кантонистов», и иудеи были уравнены с другими гражданами в отношении воинской повинности. Постепенно право жительства вне «черты оседлости» было предоставлено некоторым категориям иудеев – богатым купцам и промышленникам, лицам с высшим образованием, ремесленникам, провизорам и фельдшерам. Это помогло выявлению различных новых иудейских общин как в Центральной России, так и в Сибири.

В завершающие годы существования Российской империи достаточно резко усилилась антииудейская и антиеврейская кампания, особенно ярко проявившаяся в «деле Бейлиса», когда правительственная юстиция безуспешно пыталась обвинить киевского мещанина Бейлиса в ритуальном убийстве мальчика-христианина. После свержения царизма в 1917 г. Временное правительство отменило все правовые ограничения для иудеев. Хoтя пoсле Гражданской вoйны в СССР было реализовано гражданское равнoправие евреев, oфициальная идеология была направлена против всякой религии, в том числе и против иудаизма.

В период Великой Отечественной войны и после нее советскими властями были введены послабление в отношении религии, что коснулось также иудаизма. Однако в начале 1950-х гг. началась антисемитская и антииудейская кампания. В период «оттепели», наступившей после смерти Сталина, иудейская жизнь не была восстановлена полностью. В 1960-1961 гг. в период развернутой антирелигиозной кампании были закрыты синагоги во многих городах, а также религиозное училище (ешибот) в Москве.

В настоящее время в России происходит восстановление организационных структур, необходимых для существования и успешного развития иудейских общин. Центром еврейской религиозной жизни является Москва, где находится раввинский суд, имеющий право разрешать вопросы, относящиеся к соблюдению иудейских религиозных законов. Также существуют синагоги, различные учебные заведения, еврейские школы, работают религиозные объединения и училища. Синагоги и еврейские школы работают также в десятках других городов России. Иудаизм официально признан одной из четырех традиционных религий России.